에스케이바이오사이언스 KOSPI

총평

SK바이오사이언스는 COVID-19 백신 특수가 끝난 뒤 본업 적자가 고착된 가운데, 2024년 독일 IDT Biologika(지분 60%) 인수로 사업의 무게중심을 자체 백신에서 글로벌 CDMO로 옮긴 회사다. IDT 연결 효과로 2025년 연결 매출은 6,514억 원(+143%)으로 급증했고 CDMO가 매출의 71.5%를 차지하게 됐지만, 매출총이익률은 11.7%에 불과해 영업손실 1,235억 원·순손실 562억 원으로 적자가 이어졌다. 안동 L HOUSE 가동률 35%, IDT 47.6%로 생산설비가 절반도 못 돌고 있어, 수주잔고(약 8,000억 원) 소진과 21가 폐렴구균백신(Sanofi 공동개발, 글로벌 임상 3상) 상업화가 흑자 전환의 핵심 변수다. SK케미칼이 66.4%를 보유한 명확한 SK그룹 지배구조이며, 감사의견은 적정(한영회계법인)이다.

실적·성장 (연결)

• 매출 6,514억 원 (2024년 2,675억 → +143%). 증가분의 거의 전부가 IDT Biologika CDMO 매출(4,656억) 연결 편입 효과.
• 영업손실 -1,235억 원 (2024년 -1,384억, 2023년 -120억). 3년 연속 영업적자.
• 당기순손실 -562억 원 (지배주주 귀속 -574억, 2024년 -501억). 2023년 +223억에서 적자 전환 후 지속.
• 매출은 외형상 급증했으나 IDT의 낮은 가동률·고정비 부담으로 수익성은 오히려 악화. 법인세수익 297억 환입이 순손실 폭을 줄였다.
• 별도 기준 매출은 1,857억(+19%), 영업손실 -1,191억으로 모회사 자체 백신 사업도 적자.

사업 분석 (매출·비용 구조)

매출 구조 - CDMO 4,656억 원 (71.5%) — IDT Biologika 인수로 신설된 최대 사업부. 100년 역사의 독일 위탁개발생산 기업으로 미·유럽 cGMP·BSL-3 설비 보유. - 백신 개발·상업화 1,858억 원 (28.5%) — 제품(스카이조스터·스카이셀플루 등) 1,026억, 상품(베이포투스·헥사심 등) 595억, 용역 236억. - 지역별로 국외 매출이 5,112억(78%)으로 역전 — IDT 연결로 해외 비중이 전년 대비 급등(2024년 국외 1,361억). - 수주잔고: CDMO 약 6,961억 + 백신 원액·완제 1,049억 = 8,010억 원(2033년까지 분산).

비용 구조 - 매출원가 5,754억(원가율 88.3%) — IDT 저가동률로 원가 부담 큼. 매출총이익률 11.7%(2023년 38.5% 대비 급락). - 판관비 1,994억(매출 대비 30.6%). R&D 비용 총계 1,558억(매출 대비 23.9%)로 절대액 자체가 영업손실을 상회하는 R&D 집약 구조. - 수익성 악화는 단가가 아니라 믹스 변화(저마진 CDMO 비중 확대)+설비 저가동(안동 35%, IDT 48%)에 따른 고정비 미회수가 핵심. 환율·원자재·관세(미국 보호무역) 노출도 원가 압박 요인.

파이프라인: Sanofi 공동개발 21가 폐렴구균백신이 2024년 말부터 글로벌 임상 3상 진입 — 상용화 시 2030년 약 13조 원 규모 소아 폐렴백신 시장 진출 기대. mRNA(일본뇌염·사베코바이러스) 플랫폼도 임상 단계.

자금·자본

• 자본금 392억(보통주 78,434,701주, 액면 500원). 신용평가 미실시.
• CAPEX 활발: 유형자산이 2025년 중 1,906억 취득(건설중인자산 1,694억 포함) — 안동 L HOUSE 폐렴구균 생산시설(2025.6 준공), 송도 글로벌 R&PD센터(준공) 등 대규모 투자 진행.
• 은행차입금 등 이자부 부채 보유(연결 미할인 현금흐름 기준 약 5,404억). 모더나·화이자와의 mRNA·폐렴구균 특허소송 최종 승소로 IP 리스크 일부 해소.

주주·지배구조

• 최대주주 SK케미칼 66.37% (52,059,724주). 단, 이 중 4.88%(3,822,430주)는 SK케미칼이 2025년 9월 발행한 교환사채(EB)의 교환대상 — 사채권자 교환권 행사 시 시장에 풀릴 수 있는 잠재 오버행.
• 지배구조: SK디스커버리 → SK케미칼(40.79%) → SK바이오사이언스로 이어지는 SK그룹 계열.
• 소액주주 254,300명, 지분 26.18%. 2021년 3월 KOSPI 상장.
• 자기주식 없음. 2026년 3월 주총에서 본점 소재지를 성남 → 인천(송도)으로 변경하는 정관 안건 상정 예정.

대주주·특수관계자 거래

• SK에코플랜트 등 그룹 계열 의존: 인천 송도 R&PD센터 공사 등 부동산·자산 구입 거래가 당기 1,473억 원(SK(주) AX 1,189억 포함). 그룹 인프라 발주가 큰 비중.
• SK케미칼 등에 대한 재화 매입 16억, 기타비용(용역·임차 등) 157억. SK가스 등에 자산 매각 506억.
• 5개 비상장 종속회사(SK bioscience USA·Germany, IDT Biologika GmbH·Corporation 등) 연결.

리스크·이슈

• 저가동률·고정비: 안동 35%·IDT 48%의 가동률이 적자의 구조적 원인. 수주 확대 없이는 흑자 전환 난항.
• 환율·관세·지정학: 매출·원가의 외화 비중이 높아 환변동 노출 큼. 미국 보호무역(관세) 강화가 글로벌 조달·CDMO 수주에 불확실성.
• 파이프라인 의존: 21가 폐렴구균백신 등 후기 임상 성패가 중장기 실적을 좌우하는 전형적 R&D 집약 리스크.
• EB 교환에 따른 잠재 물량 출회 가능성.

감사 의견

• 한영회계법인, 적정의견(별도·연결 모두). 내부회계관리제도도 적정.
• 핵심감사사항(KAM): 재고자산 평가 — 백신·CDMO 재고의 진부화·순실현가능가치 평가가 주요 감사 초점.