토모큐브 KOSDAQ

총평

토모큐브는 빛의 회절을 이용해 세포·조직을 염색 없이 3D로 관찰하는 홀로토모그래피(HT) 현미경을 만드는 KAIST 박용근 교수 창업기업으로, 2024년 11월 기술성장기업 특례로 코스닥에 상장했다. 2025년(제11기) 연결매출이 113억원으로 전년 대비 +90% 급성장했고 매출의 약 76%가 수출인 글로벌 R&D 장비 회사다. 다만 R&D·판관비 부담으로 영업손실 56억원이 이어지는 적자 성장 단계이며, 상장으로 확보한 현금이 풍부해(현금성+단기금융 약 287억, 부채비율 7%) 당분간 자금 우려는 낮다. 상장 직후인 2025년 11월 의결권 공동행사 약정 만료로 한미사이언스(4.82%)와의 특수관계가 해소된 점이 지배구조상 주목할 변화다.

실적·성장

• 매출 113.1억원 (제11기) — 전년 59.4억 대비 +90.4%. 제9기 37.5억 → 제10기 59.4억 → 제11기 113.1억으로 가파른 상승 곡선.
• 영업손실 -55.7억원 — 전년 -87.8억 대비 적자 폭 축소. 매출총이익(74.4억)을 판관비(130.1억)가 크게 상회하는 구조라 여전히 적자.
• 당기순손실 -48.1억원 (전년 -83.0억). 주당손실 -365원.
• 적자 축소의 핵심은 매출 급증과 R&D비 안정화(전년과 유사한 절대액이지만 매출 대비 비율은 91%→46%로 급락)이며, 본업 손익이 규모의 경제로 개선되는 초기 국면.

사업 분석 (매출·비용 구조)

• 매출 구조: HT 제품군이 매출의 93.3%(105.5억), 소모품·SW·워런티 등이 6.7%. 지역별로는 수출 75.9%·내수 24.1%로 수출 의존이 높고, 전년(수출 41%)과 비교해 수출 비중이 급등 — 해외 성장이 외형 확대를 견인. 판매경로는 직접판매와 대리점이 거의 반반(수출 부문은 대리점 비중이 더 큼). 주요 매출처가 특정 1~2개사에 쏠리지 않고 분산(상위 6개사 각 3~7%, 기타 69%)돼 고객 집중 리스크는 낮은 편. MIT·하버드·ETH Zurich 등 전 세계 50개국 200여 기관에 보급. 글로벌 경쟁사는 스위스 N사가 사실상 유일.
• 비용 구조: 매출원가율 약 34%로 매출총이익률 65.8%의 고마진 구조이나, 판관비가 매출을 상회(130억 vs 113억)하는 것이 적자의 본질. 그중 연구개발비(판관비)가 52.2억으로 압도적 — 매출 대비 R&D 비율 46.2%(전년 90.7%, 제9기 97.9%). 박사 12·석사 17명 포함 R&D 인력 44명을 대전 R&D센터·서울 AI연구소 2개 부설연구소에서 운용.
• 수익성 변화의 원인: 신제품(HT-X1 Plus/mini) 출시에 따른 제품 믹스 개선으로 평균판매단가(ASP) 상승. 매출 급증으로 고정성 R&D·판관비가 희석되며 영업손실률이 크게 개선. 일회성보다는 외형 성장에 의한 본업 레버리지가 작동 중. 생산가동률도 38%→44%→69%로 상승.

자금·자본

• 자본금 66.6억(보통주 13,321,774주, 액면 500원). 2024년 100% 무상증자 + 코스닥 상장 시 신주 206만주 발행으로 자본 확충.
• 현금성자산 114억 + 단기금융상품 172억 등 가용 유동성 약 287억, 부채총계 27억으로 부채비율 7.0%(전년 3.9%) — 차입 부담이 거의 없는 무차입 경영에 가까운 재무구조.
• 신용등급은 이크레더블 B(2025.07, 유효 2026.06) — 적자 기업 특성상 낮은 수준.
• 매년 50억대 R&D 투자가 지속되나 무형자산화 없이 전액 판관비로 비용처리(보수적 회계). 다수 국책과제(소부장·바이오 R&D 등 진행 중 과제 정부출연금 합산 수십억 규모) 수행.

주주·지배구조

• 최대주주 박용근 대표이사 17.26%, 특수관계인 홍기현 7.51%. 소액주주 28,523명이 발행주식의 57.1% 보유(상장사 분산).
• 한미사이언스(4.82%)가 2025.11.7 의결권 공동행사 약정 만료로 특수관계 해소되며 보유분이 특수관계인 집계에서 빠짐 — 최대주주측 합산 지분이 33.3%→26.6%로 감소.
• 이사회는 사내이사 2(박용근·고성호)·사외이사 3, 별도 위원회 없음. 박용근 대표가 이사회 의장 겸임. 2025년 사내이사 오경태·홍기현이 사임. 자기주식 없음.
• 상장 첫해 주가는 2025년 하반기 월평균 2.5만~5.3만원대에서 변동(12월 최고 62,700원), 거래는 활발.

대주주/특수관계자 거래

• 대주주 신용공여·자산양수도·영업거래·주식기준보상 등 대주주 등과의 거래는 전 항목 해당사항 없음. 그룹 계열 의존이나 내부거래 이슈 없음.
• 종속회사는 미국 법인(Tomocube USA)에 더해 2025년 6월 독일 법인(Tomocube Europe GmbH) 신규 설립 — 유럽·중동 직판 강화.

리스크·이슈

• 지속 영업적자 — 외형은 빠르게 크지만 판관비>매출 구조로 흑자 전환 시점이 핵심 관전 포인트.
• 수출 76% → 환율 노출 — 주로 USD. 환율 10% 변동 시 손익 영향 약 6.9억원(세전).
• 핵심 인력·기술 의존 — 창업자 겸 최대주주 박용근 교수(KAIST 교수 겸직)의 기술 리더십 의존도가 높음. 보유 특허 92건(등록 54·출원 38).
• 반도체·디스플레이 산업용 계측(반사형 HT) 등 신사업은 아직 초기.

감사 의견

• 삼덕회계법인, 별도·연결 모두 적정의견(제11기). 의견변형·계속기업 불확실성·강조사항 없음.
• 핵심감사사항(KAM): "중요계정의 변동사항에 대한 재무제표 분석적 절차수행" (전년 KAM은 제품매출의 발생사실·귀속기간 검토). 세부 회계 디테일 특이사항 없음.
• 내부회계관리제도 검토 적정.